С 2015 года «НОДКБ» участвует в программе оказания ВМП по следующим профилям: абдоминальная хирургия, гематология, нейрохирургия, неонатология, онкология, педиатрия, урология, челюстно-лицевая хирургия, детская хирургия в период новорожденности, трансплантация костного мозга.

С 2016 года высокотехнологичная медицинская помощь стала доступна детям с заболеваниями ЛОР-органов, патологией органов зрения, включая ретинопатию недоношенных.

С 2018 года ВМП оказывается детям с распространенными формами системного склероза, кардиомиопатией, тяжелыми формами бронхиальной астмы, ювенильного ревматоидного артрита, тяжелыми формами сахарного диабета с установкой помповых дозаторов инсулина.

За 2018 год высокотехнологичную медицинскую помощь получило 742 человека.

За 2019 – 444 человека.