В патологоанатомическом отделении НОДКБ осуществляются исследования операционно-биопсийного материала с морфологической диагностикой широкого спектра как детской, так и взрослой патологии. Проводится консультативная помощь в диагностике заболеваний по предоставленным готовым гистологическим препаратам, парафиновым блокам, а также по необработанному (нативному) операционно-биопсийному материалу, присланному из медицинских организаций Нижегородской области и других регионов России.

В отделении работают высококвалифицированные врачи–патологоанатомы со стажем работы более 12 лет и фельдшеры-лаборанты с высшей квалификационной категорией.

Операционно-биопсийный материал исследуется с применением метода парафиновой проводки тканей.

С 2002 года в отделении освоен метод микроскопического исследования нефробиопсий для диагностики различных заболеваний почек у детей и взрослых с применением гистохимических, иммунофлюоресцентных методов окрашивания и электронной микроскопии в сотрудничестве с ЦНИЛ ПИМУ.

В 2005 году открылась первая в Нижнем Новгороде иммуногистохимическая лаборатория, осуществляющая диагностику широкого спектра онкологических заболеваний бесплатно для детского и на платной основе для взрослого населения. В 2014 году лаборатория участвовала в этапе добровольного контроля качества исследований среди 28 лабораторий России и заняла 2-е место; в этом же году иммуногистохимическая лаборатория стала референс-центром диагностики онкогематологических заболеваний, выполняя исследования материала пациентов из Тулы, Оренбурга, Саратова, Саранска, Самары, Казани.

В настоящее время иммуногистохимическая лаборатория патологоанатомического отделения является единственным консультативным центром по диагностике гематологических и лимфопролиферативных заболеваний как детского, так и взрослого населения Нижегородской области.

В патологоанатомическом отделении проводится прижизненные патологоанатомические исследования трепанобиоптатов костного мозга при различной гематологической патологии с применением иммуногистохимических методов исследования у взрослых и детей.

Для постоянного повышения квалификации врачи патологоанатомического отделения участвуют в международных и общероссийских конференциях патологоанатомов , проходят тематические и общие усовершенствования , внедряют новые методы исследования в патологической анатомии

Врачи патологоанатомического отделения ГБУЗ НО "НОДКБ" оказывают консультативную помощь нижегородским врачам-патологоанатомам по прижизненным патологоанатомическим исследованиям операционного (биопсйного) материала и посмертным патологоанатомическим исследованиям (вскрытия).